世界卫生组织建议，一般结核与HIV合并感染者在抗病毒治疗前，先完成结核的治疗。HIV感染者或艾滋病病人与未感染HIV的结核病人在抗结核治疗上基本是相同的。惟一例外是氨硫脲在感染了HIV的结核病人中并不推荐使用，因为HIV感染者使用氨硫脲后可能产生严重甚至致命的皮肤反应。艾滋病感染者的结核病治疗的常见问题包括：无法坚持治疗，不利的药物反应增加和并发其他机会性感染，因此对在治疗过程中出现的各种反应必须密切观察。